аутофосфорилированию, он дважды пронизывает внутреннюю мембрану бактериальной
клетки и выступает в качестве донора фосфора белку VirG. Фосфорилированный
VirG активирует транскрипцию остальных vir-генов. Индукция vir-генов
обратима, что очень важно для патогена: в случае, если хозяин - больной и
нежизнеспособный организм, перенос Т-ДНК не осуществляется.
Оперон VirD кодирует несколько продуктов. Один из них является
двухкомпонентной эндонуклеазой. Область Т-ДНК окружена одинаковыми повторами
длиной 25 пар оснований. Эти последовательности являются сайтами узнавания
VirD-эндонуклеазы, режущей точно между 3-м и 4-м основаниями 25 пар оснований
повтора. Эта эндонуклеаза ответственна за вырезание Т-ДНК. Белки VirB и VirE
необходимы для транспорта Т-ДНК из бактерии в растение. Перенос Т-ДНК из
бактерии в цитоплазму растительной клетки осуществляется за 30 мин.
Внедрение Т-ДНК в растительный геном является многоступенчатым процессом.
Недавние результаты анализа нуклеотидных последовательностей в участках
растительной ДНК, в которые инкорпорируется Т-ДНК, показали, что есть
гомология между растительной ДНК по обеим сторонам от места встраивания и
наружными областями плазмидной ДНК агробактерий. В геном растения могут
встраиваться несколько копий Т-ДНК. После встраивания в хромосому Т-ДНК
становится обычной частью генома растения. Т-ДНК транскрибируется в
растительных клетках РНК-полимеразой II растения-хозяина. Транскрипты имеют
особенности эукариотических матриц. Сама бактерия в клетку не проникает, а
остается в межклеточном пространстве и использует растительные клетки со
встроенной Т-ДНК как фабрику, продуцирующую опины - источник азота и
углерода.
2.6. ДНК Ti-ПЛАЗМИДЫ МОЖНО ИСПОЛЬЗОВАТЬ В КАЧЕСТВЕ ВЕКТОРА
Т-ДНК Ti-плазмид обладает двумя свойствами, делающими ее по существу
идеальным вектором для введения чужеродных генов в клетки растений. Во-
первых, круг хозяев агробактерий очень широк: они трансформируют клетки
практически всех двудольных растений. Известно, что можно добиться заражения
однодольных, в том числе злаков. Во-вторых, интегрированная в состав генома
растения Т-ДНК наследуется как простой доминантный признак в соответствии с
законами Менделя, а ее гены имеют собственные промоторы (регуляторная область
гена, определяющая время и место его экспрессии), под контролем которых могут
экспрессироваться вставленные в Т-ДНК чужеродные гены.
Простейший способ введения Т-ДНК в клетки растения состоит в том, чтобы
заразить его A. tumefaciens, содержащей подходящую Ti-плазмиду, и
предоставить дальнейшее естественному ходу событий. Необходимо только уметь
встраивать нужные гены в Т-сегмент ДНК плазмиды. Однако размеры целой Ti-
плазмиды существенно больше размеров молекул, обычно используемых в работе с
рекомбинантной ДНК. Чтобы преодолеть эту трудность, разработан следующий
подход. Прежде всего Т-сегмент вырезают из Ti-плазмиды с помощью рестриктаз и
встраивают в один из стандартных плазмидных векторов для размножения в
клетках бактерий - Escherichia coli. E. сoli содержит плазмиду pBR322,
которая способна к саморепликации, то есть размножению, приводящему к
увеличению числа ее копий. После того как в плазмиду pBR322 внедрили участок
Ti-плазмиды, это рекомбинантная структура может затем реплицироваться
многократно, что приводит к увеличению числа копий участков Ti-плазмиды. Этот
процесс называется клонированием. Бактерии, содержащие плазмиду pBR322 с
участком Т-ДНК, размножают, после чего эту плазмиду выделяют. Затем с
использованием рестриктаз и стандартных приемов работы с рекомбинантной ДНК в
Т-сегмент встраивают определенный ген. Этот молекулярный гибрид, теперь уже
содержащий Т-ДНК со встроенным в нее геном, снова размножают в E. сoli, а
затем вводят в клетки A. tumefaciens, несущие соответствующую полную Ti-
плазмиду. В результате обмена идентичными участками (гомологичная
рекомбинация) между Т-сегментами нативной и сконструированной Ti-плазмид Т-
ДНК со встроенным чужеродным геном включается в Ti-плазмиду, замещая
нормальную Т-ДНК. Таким образом, мы получаем клетки A. tumefaciens, несущие
Ti-плазмиду со встроенным в Т-сегмент нужным геном. Последний этап
заключается в заражении растений этими модифицированными генно-инженерными
методами агробактериями. Клетки полученных трансгенных растений будут
содержать интегрированную Т-ДНК со встроенным чужеродным геном, то есть цель
работы, состоявшая во введении данного гена в геном растения, будет
достигнута. Недавние исследования, однако, показали, что эту процедуру можно
упростить, если использовать бинарные векторные системы, создание которых
заключается в том, что агробактериальная клетка должна содержать по крайней
мере две разные модифицированные Ti-плазмиды. Одна из них должна содержать
только vir-область, гены которой будут участвовать в вырезании Т-ДНК. Такие
плазмиды называют плазмидами-помощницами. Вторая Ti-плазмида должна содержать
область Т-ДНК с нужным встроенным геном. Продукты vir-генов способны вырезать
Т-ДНК как на собственной плазмиде, так и на соседней, то есть vir-гены могут
работать вне зависимости от их местоположения. Таким образом, если клетки
агробактерии содержат Ti-плазмиду с сегментом vir и другую плазмиду с Т-ДНК,
несущей встроенный ген, эти бактерии могут трансформировать клетки растений.
В целом идеальная векторная система на основе Ti-плазмиды должна: 1)
содержать все сигналы, необходимые для переноса и стабильной интеграции в
ядерную ДНК растений; систему для экспрессии чужеродных генов в растениях
(узнаваемый растительными полимеразами промотор), маркер, который необходим
для селекции трансформированных клеток; 2) не содержать онкогенов, то есть
генов, которые подавляют дифференцировку растительных клеток. Второй пункт
достигается с помощью транспозонного мутагенеза (транспозон -
последовательность ДНК, способная перемещаться по геному). В результате
введения транспозона в Т-ДНК можно выключить гены, которые приводят к
опухолеобразованию (iaaM, iaaH, ipt), что не отражается на механизме переноса
Т-ДНК. Обычно используют бактериальные транспозоны (Tn5, Tn7). При этом
снимается блок с процессов регенерации. При модификации Ti-плазмиды
необходимо предусмотреть также наличие уникальных сайтов рестрикции, в
которые будет клонирован чужеродный фрагмент ДНК. Такие уникальные сайты
рестрикции создаются включением в искусственные Ti-конструкции
последовательностей, которые содержат множественные сайты разрезания для
рестриктаз EcoR1, Hind III, BamH1 и др. В некоторых случаях в одном
множественном сайте имеется 18-20 сайтов, узнаваемых разными рестриктазами,
почему эти участки и называются полилинкерами.
Кроме того, при конструировании векторных молекул должно быть предусмотрено
наличие промоторов, работающих в растениях. Промотор (участок, к которому
присоединяются РНК-полимеразы) должен обладать набором свойств, а именно:
силой (активной экспрессией), возможностью регуляции, ткане- и
органспецифической экспрессией. Так, например, к регулируемым промоторам
относится промотор генов белков теплового шока (генов, активность которых
индуцируется при повышенной температуре), а тканеспецифичная экспрессия
характерна для генов, контролирующих синтез запасных белков, например зеина,
который обнаружен только в тканях семян злаков. Наиболее популярным является
промотор гена вируса мозаики цветной капусты (CAMV). Гены, подшитые к такому
промотору, активно экспрессируются во всех тканях.
Наконец, в векторе должны быть предусмотрены маркеры, с помощью которых
возможен отбор трансгенных растений. В литературе маркерные гены еще называют
репортерными. Их достаточно много. Например, luxA и luxB - это гены,
выделенные из ДНК светлячков. Они контролируют синтез люциферазы, которая
обеспечивает переход люцефиринов из окисленной формы в основную, что и
обеспечивает свечение. В последнее время пользуется популярностью другой
репортерный ген - pgfp, который контролирует синтез GFP-белка (green
fluorescent protein). Этот ген был выделен из ДНК медузы Acquorea victoria.
Трансгенные растения с этим геном светятся в ультрафиолете зеленым светом.
Традиционный способ трансформации растительных клеток с помощью Т-ДНК
заключается в нанесении агробактерий, содержащих Ti-плазмиду, на специально
поврежденный побег. Сейчас используют широкий арсенал методов для получения
трансгенных растений. Создан даже специальный прибор - "Shotgun", который
стреляет мельчайшими вольфрамовыми пульками, одетыми в молекулы ДНК,
осуществляя таким образом трансформацию растительных клеток.
2.7. ПРАКТИЧЕСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ИНЖЕНЕРИИ РАСТЕНИЙ С
ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ Ti-ПЛАЗМИД
Еще несколько лет назад ученые задавали вопрос, можно ли создать сорта,
сбалансированные по составу аминокислот, устойчивые к холоду, засухе, не
поражаемые вредителями. Сегодня можно с уверенностью утверждать, что такие
трансгенные растения уже вышли в поле. По литературным данным, к 1997 году в
30 странах мира проведено более 3 тыс. полевых испытаний. В этих
экспериментах использовали трансгенные растения 40 различных видов,
относящихся к разным семействам, включая злаки. После успешных экспериментов
появились опасения о возможном вреде генетической инженерии для природы и
человечества. Однако уже более чем за четверть века своего существования
генетическая инженерия не принесла ущерба ни природе, ни человеку. Главное, в
любых экспериментах по генной инженерии следует соблюдать разработанные
правила.
Наиболее остро стоит вопрос о получении растений, устойчивых к вредителям
сельского хозяйства, так как болезни растений стали основным лимитирующим
фактором получения урожая. В арсенале генной инженерии растений есть много
приемов, позволяющих получить трансгенные растения, устойчивые к насекомым.
Традиционно используют ген bt, продуктом которого является бактериальный
токсин Bacillus thuringiensis. Эта тюрингская бактерия продуцирует крупный
белок (протоксин), контролируемый геном bt, который, попадая в кишечник
личинок насекомых, разрушается под действием ферментов, а его фрагмент
(эндотоксин) приводит к их гибели. На приведена схема конструирования вектора
и получения трансгенных растений хлопка, которые приобретают признак
устойчивости к насекомым. В настоящее время уже синтезирован искусственный
ген bt, конструкция с которым более эффективна, а сами трансгенные растения
обладают широким спектром устойчивости к насекомым. Трансгенные растения
картофеля, хлопка, кукурузы с геном bt уже производятся фирмами "Monsanto",
"Ciba Seeds" и продаются на рынках мира, хотя дискуссии об их использовании
еще не закончены.
Известно, что растения, так же как и животные, способны вырабатывать
иммунитет. Этим замечательным свойством обладают только устойчивые растения,
у которых при атаке патогенов сильно меняется метаболизм. Например, у
устойчивых растений накапливаются такие химические соединения, как перекись
водорода (Н2О2), салициловая кислота (SA), фитоалексины (соединения,
выполняющие защитную функцию в растении). Повышенное содержание этих
соединений способствует противостоянию растения в борьбе с патогенами. Вот
один из примеров, доказывающий роль салициловой кислоты в иммунном ответе
растений. Трансгенные растения табака, которые содержат бактериальный ген,
контролирующий синтез салицилат гидролазы (этот фермент разрушает SA), были
неспособны к иммунному ответу. Поэтому изменение генно-инженерным путем
уровня салициловой кислоты или выработки в растениях в ответ на патоген H2O2
может быть перспективным для создания устойчивых трансгенных растений.
В последние годы ученые используют новый подход для получения трансгенных
растений с "antisense RNA" (перевернутой или антисмысловой РНК), который
позволяет управлять работой интересуемого гена. В этом случае при
конструировании вектора копию ДНК (к-ДНК) встраиваемого гена переворачивают
на 180?. В результате в трансгенном растении образуется нормальная молекула
мРНК и перевернутая, которая в силу комплементарности нормальной мРНК
образует с ней комплекс и закодированный белок не синтезируется. Такой подход
использован для получения трансгенных растений томатов с улучшенным качеством
плодов. Вектор включал к-ДНК гена PG, контролирующего синтез
полигалактуроназы (polygalacturonase) - фермента, участвующего в разрушении
пектина, основного компонента межклеточного пространства растительных тканей.
Продукт гена PG синтезируется в период созревания плодов томатов, а
увеличение его количества приводит к тому, что томаты становятся более
мягкими, что значительно сокращает срок их хранения. Отключение этого гена в
трансгенах позволило получить растения томатов с новыми свойствами плодов,
Страницы: 1, 2, 3, 4, 5, 6
|